YÖK Yasa taslağında, rektörlük seçimleri ile ilgili yapılan değişiklikler, büyük üniversitelerde rektör seçimlerinin "üniversite konseyi" tarafından yapılacak olması, rektörlerin görev sürelerinin kısaltılması gibi birçok konu rektörlerin tepkisini çekti.