2000-04 yılları arasında da Türkiye’yi çalıştıran Güneş, millileri 48 yıl sonra Dünya Kupası’na götürmeyi başarmıştı. Japonya ve Güney Kore’nin ev sahipliğini yaptığı 2002’deki şampiyonadan da dünya üçüncüsü olarak dönen Güneş, Türkiye, Letonya’ya elenerek Avrupa Futbol Şampiyonası biletini yitirince görevden alınmıştı.