Güncelleme Tarihi:
12 Haziran 2007 Ümraniye’de bir gecekonduya yapılan baskında 27 adet el bombası bulundu.
26 Haziran 2007 Eskişehir’de bir evde patlayıcı ve silahlar bulundu.
21 Ocak 2008 Emekli Tümgeneral Veli Küçük tutuklandı.
21 Şubat 2008 Dördüncü Dalga operasyonda çok sayıda akademisyen tutuklandı tutuklandı.
21 Mart 2008 Aralarında İşçi Partisi Genel Başkanı Doğu Perinçek, gazeteci İlhan Selçuk, Prof. Dr. Kemal Alemdaroğlu'nun da bulunduğu bazı kişiler gözaltına alındı. Perinçek 24 Mart'ta tutuklandı; Selçuk ve Alemdaroğlu tutuksuz yargılanmak üzere serbest bırakıldı. (Selçuk, 21 Haziran 2010'da vefat etti)
5 Temmuz 2008 Emekli Orgeneraller Şener Eruygur ve Hurşit Tolon tutuklanarak Metris Cezaevi’ne gönderildi.
14 Temmuz 2008 İlk iddianame mahkemeye sunuldu.
23 Temmuz 2008 stanbul Üniversitesi Orman Fakültesi Öğretim Üyesi, İP Merkez Karar Kurulu Üyesi Uçkun Geray, Gemi Mühendisleri Odası Silifke temsilcisi, Ulusal Kanal Çalışanı Yusuf Buldu, İşçi Partisi Üyesi Ulusal Kanal Çalışanı Nuran Gökdemir, Milli Çözüm Dergisi Yayın Müdürü Ahmet Akgül ve Mevlüt Sungur gözaltına alındı.
14 Ağustos 2008 Emekli Albay Arif Doğan yakalandı.
18 Eylül 2008 8. dalga operasyonda çok sayıda gözaltı oldu. Gözaltına alınanlara arasında televizyoncu Tuncay Özkan, JİTEM'in kurucusu olduğu iddia edilen albay Arif Doğan, eski İstanbul Organize Suçlarla Mücadele Şube Müdürü Adil Serdar Saçan, Ülkü Ocakları eski Başkanı Levent Temiz, beş teğmen ve bir askerî öğrenci ve bazı İşçi Partisi ve Biz kaç kişiyiz hareketi yetkilileri de bulunuyor.
23 Eylül 2008 İstanbul, Ankara ve İzmir’de eşzamanlı yürütülen operasyonlarda aralarında Kanaltürk’ün eski sahibi, gazeteci Tuncay Özkan ve eski Esenyurt Belediye Başkanı Gürbüz Çapan ve KanalTürk eski Haber Müdürü Adnan Bulut’un da bulunduğu çok sayıda gözaltı yaşandı.
20 Ekim 2008 Ergenekon davasında yargılama süreci başladı.
17 Aralık 2008 Danıştay davası ve Ergenekon davası birleştirildi.
7 Ocak 2009 10. Dalga operasyonunda Orgeneral Tuncer Kılınç, Tümgeneral Erdal Şenel ve eski YÖK Başkanı Kemal Gürüz gözaltına alındı.
22 Ocak 2009 Ankara, İstanbul ve Bursa başta olmak üzere çok sayıda ilde yapılan operasyonlarda muvazzaf subaylar ve polislerinde aralarında bulunduğu birçok kişi gözaltına alındı,
06 Mart 2009 Mustafa Balbay tutuklandı.
10 Mart 2009 Davanın ikinci iddianamesi hazırlandı.
13 Nisan 2009 Ergenekon soruşturması kapsamında 18 ilde 50 kişiye ait 83 adreste arama yapıldı.[69] Aralarında Başkent Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Mehmet Haberal, İnönü Üniversitesi eski Rektörü Prof. Dr. Fatih Hilmioğlu, 19 Mayıs Üniversitesi eski Rektörü Prof. Dr. Ferit Bernay, Atatürkçü Düşünce Derneği Genel Başkanvekili ve eski Uludağ Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Mustafa Yurtkuran ve Prof. Dr. Erol Manisalı'nın da bulunduğu 39 kişi gözaltına alındı.
4 Haziran 2009 13 dalgada Poyrazköy’deki cephanelikle ilgili soruşturma sonucunda pek çok muvazzaf asker tutuklandı.
30 Haziran 2009 Dursun Çiçek ve sekiz albayın ifadesi alındı.
18 Temmuz 2009 Anayasa Mahkemesi, üye Osman Paksüt’ün yargılanmasına izin vermedi.
20 Temmuz2009 Üçüncü İddianame mahkemeye sunuldu.
3 Ağustos 2009 Danıştay Saldırısı davası ile Ergenekon davası resmen birleştirildi.
5 Ocak 2012 İnternet Andıcı Soruşturması kapsamında ’şüpheli’ sıfatıyla ifadeye çağrılan Genelkurmay eski Başkanı İlker Başbuğ tutuklandı.
5 Nisan 2012 İkinci "Ergenekon" davasına bakan İstanbul 13. Ağır Ceza Mahkemesi, "İrtica ile Mücadele Eylem Planı" davasının bu davayla birleştirilmesine karar verdi.